אולפן שדה אליהו נמצא בפיקוחו ובאחריותו הפדגוגית של האגף לחינוך מבוגרים במשרד החינוך. המנהל/ת ומורי האולפן הם עובדי האגף לחינוך מבוגרים במשרד החינוך, שמקבלים ליווי והדרכה פדגוגית. האגף לחינוך מבוגרים אחראי על התנהלות האולפן, תכניות הלימודים ועל ההתפתחות המקצועית של המורים. המורים באולפן הינם בעלי תארים אקדמיים, נמצאים במערכת החינוך שנים ארוכות, בעלי ניסיון רב, גמישות ומיומנות בהוראת שיטות לימוד שונות ומגוונות.
בשונה משאר אולפני הקיבוץ, קיבוץ שדה אליהו הוא הקיבוץ הדתי היחיד בארץ בו מתקיים אולפן לעברית. רק כאן יש לצעירים אפשרות לחיות באורח החיים הקיבוצי שהוא גם דתי, דבר המסייע למתלבטים להחליט מה נכון להם.
באולפן מתקיימים שני מחזורי לימוד בשנה: אולפן סתיו (בספטמבר) ואולפן אביב (במרס).
לאולפן מגיעים צעירים מכל העולם, מגילאי 18 ומעלה, עולים חדשים ותיירים (בתשלום).
כמו שאר אולפני הקיבוץ, גם אולפן שדה אליהו הוא אולפן-עבודה. כלומר, יש שילוב של לימודי
עברית באולפן ועבודה בענפי המשק השונים, שם ניתן גם לתרגל את השימוש בשפה העברית.
באולפן קיימות בדרך כלל שתי כיתות. בתחילת כל מחזור התלמידים עוברים מבחן מיון, אשר לפי תוצאותיו הם משובצים בכיתה המתאימה לרמתם. יש אפשרות לניידות בין הכיתות לפי הצורך.
החל מ-תשע"ד, מלבד מורי האולפן הקבועים, יש מורה נוספת (שפרשה מהאולפן לגמלאות) המסייעת לתלמידים שנמצאים ב"שני הקצוות", וכך כולם מקבלים מענה לצרכיהם.
כמו-כן נמצאת בת שרות לאומי שעומדת לרשות האולפן, לעזרה למורה ולתלמידים.